Das klingt sehr merkwürdig und ist mir noch nicht untergekommen.
Zunächst mal musst du eigentlich auch nichts selber umbenennen oder die Logos manuell abändern, das sollte durch die Installation der CED-Dateien automatisch geschehen.
Wichtig ist, dass du nach dem erfolgten Import den Editier-Modus beendest, damit das Spiel die Editierten Dateien auch überschreibt.
Mein Lösungsansatz wäre daher jetzt folgender:
Schau erstmal nach, ob du wirklich die Live-Aktualisierungen ausgeschaltet hast. Dazu im Anstoß-Modus L3 drücken und "Live-Aktualisierung aus" anwählen, auch wenn du dir sicher bist, es getan zu haben. Das Spiel haut die Einstellung immer raus!
Sollte dies nicht klappen:
Editierte Dateien komplett löschen, um eine cleane Installation zu haben. PESGalaxy/PESUnites v9 Patch installieren, abspeichern, gucken, ob es funktioniert.
Anschließend einige vierte Trikots löschen. Nun erstmal die TED-Dateien der 2. Bundesliga importieren. Im Anschluss die Wettbewerbe (CED-Dateien) importieren. Dann prüfe mal noch im Edit-Modus, ob alles passt, oder ob es da schon unstimmig ist. Wenn alles im Lot ist, Edit-Modus verlassen und abspeichern lassen.
Die einzige Einstellung, wie womöglich vorgenommen werden muss, ist die PEU-Liga auf 20 Mannschaften abzuändern. Allerdings ist dies die Standard-Einstellung des Spiels, sodass sich das mit einer sauberen Installation eigentlich erübrigen dürfte.